这样的处罚是否合法？

旷工被扣三天工资不一定合法。依据《劳动法》，若旷工造成损失且合同有约定，扣工资需合法且不超过月工资的20%。无故克扣或拖欠工资违法，可能导致劳动纠纷及赔偿。
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旷工扣工资需分情况。操作如下：1.查看劳动合同，是否有旷工扣工资的约定，且扣除是否合法；2.若无约定或扣除不合法，与单位沟通，要求改正；3.沟通无果，可向劳动仲裁机构申请仲裁或提起诉讼，维护自身权益。
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旷工扣工资处理方式需视情况。若合同有约定且合法，可按约定处理；若无约定或违法扣除，应申请劳动仲裁或诉讼。选择方式需根据具体情况和证据决定。